目的为相识虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因漫衍和全基因组信息,并起源评估达卡气单胞菌的致病性。
要领对虾源疏散株举行分子判断和多位点序列分型:使用B-溶血和胞外卵白酶实验、秀丽隐杆线液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性:通过药罐实验及耐药基因检测剖析其耐药特征:使用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序枚举行剖析。
效果菌株18FX22判断为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要体现:有一溶血能力和胞外卵白酶活性:对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发明其对阿莫西林/克拉维酸,头孢座林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序效果 发明:18FX22的全基因组巨细为4811079bp,GC含量为61.33%。C0G注释发明18FX22共有3850个基因,具有20类功效。前噬菌体展望效果 发明18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类效果 显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。
结论本研究从商品虾疏散出达卡气单胞菌,发明该菌株的毒性较强,指示应增强海鲜食物清静的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考。
阅读原文:虾源达卡气单胞菌全基因组剖析和致病性研究.pdf